วันที่ 26 กันยายน 2559 นายสมศักดิ์ จังตระกุล ผู้ว่าราชการจังหวัดอุบลราชธานี นำกำลังพลทุกภาคส่วน ทำการวางกระสอบทรายตามแนวริมฝั่งแม่น้ำมูล บริเวณจุดเสี่ยง เชิงสะพานเสรีประชาธิปไตย เขตเทศบาลเมืองวารินชำราบ อำเภอวารินชำราบ เพื่อป้องกันน้ำมูลไหลทะลักเข้าท่วมพื้นที่ชุมชน เนื่องจากปริมาณน้ำในแม่น้ำมูลเริ่มสูงขึ้นอย่างต่อเนื่อง และพื้นที่ดังกล่าวในฤดูน้ำหลากมักจะถูกน้ำท่วมทุกปี โดยได้จัดเตรียมกระสอบทรายกว่า 3 พันกระสอบ เพื่อวางแนวผนังกั้นน้ำให้มีขนาดความสูง 50 เชนติเมตร เป็นระยะทางประมาณ 100 เมตร 

ผู้ว่าราชการจังหวัดอุบลราชธานี กล่าวอีกว่า หลังจากนี้ ทางจังหวัดจะเข้าไปสำรวจพื้นที่เสี่ยงอุทกภัยในเขตอำเภอเขื่องใน ซึ่งอาจจะได้รับผลกระทบจากน้ำชี ที่ไหลมากจากจังหวัดร้อยเอ็ด จังหวัดยโสธร เข้ามายังเขื่อนธาตุน้อย อำเภอเขื่องใน โดยในเบื้องต้นรับแจ้งว่ายังไม่มีความเสียหายรุนแรงแต่อย่างใด

อย่างไรก็ตาม ได้มีการเปิดประตูระบายน้ำเขื่อนปากมูล และเขื่อนสิรินธร มาก่อนหน้านี้แล้วกว่า 2 เดือน เพื่อเป็นการพร่องน้ำในพื้นที่ และหากพื้นที่ใดประสบปัญหาอุทกภัย ทางจังหวัดเตรียมเจ้าหน้าที่ และอุปกรณ์ เพื่อช่วยเหลืออย่างเร่งด่วน

สำหรับสถานการณ์ระดับน้ำในแม่น้ำมูล วันที่ 26 กันยายน 2559 อยู่ที่ 111.4 เมตร (รทก.) ซึ่งยังต่ำกว่าตลิ่งอยู่ 0.6 เมตร (ระดับตลิ่งงั่ง อ.วารินชำราบ 112.0 เมตร รทก.) และระดับน้ำโขงที่ อำเภอโขงเจียมก็ยังต่ำกว่าตลิ่งอยู่ 5 เมตร แต่ต้องเฝ้าติดตามและเฝ้าระวังอย่างใกล้ชิดเพราะมวลน้ำในแม่น้ำชีจากจังหวัดร้อยเอ็ดและยโสธรกำลังจะมาถึงแม่น้ำมูลที่จังหวัดอุบลราชธานี รวมทั้งมวลน้ำในแม่น้ำมูลจากจังหวัดบุรีรัมย์และสุรินทร์ กำลังจะมาถึงเช่นกันหากในช่วงจากนี้ไปมีฝนตกลงมาในพื้นที่ก็อาจทำให้เกิดน้ำเอ่อล้นตลิ่งท่วมพื้นที่ลุ่มต่ำริมฝั่งแม่น้ำได้